La subdirección de Áreas Protegida y Vida Silvestre es la responsable de coordinar y ejecutar las políticas relacionadas con la protección, el fomento, la biodiversidad y el aprovechamiento cuando éste tenga como fin el abastecimiento de agua, recolección de muestras y material genético para estudio científico, ecoturismo y todo lo relacionado con el Sistema Nacional de Áreas Protegidas de Honduras (SINAPH), así como lo relacionado con los Parques Nacionales, zonas de reserva, biosferas, zonas forestales protegidas, y todo lo relacionado con la protección de la vida silvestre

Esta dependencia estará a cargo de un Sub-Director/a Ejecutivo/a, quien tendrá rango de Subsecretario de Estado y actuará bajo la dependencia del Director/a Ejecutivo/a y tendrá, entre otras, las siguientes atribuciones:

a) Supervisar y evaluar el cumplimiento de los Planes de Manejo para la conservación, protección, aprovechamiento racional y sostenible de las áreas protegidas y vida silvestre;

b) Aprobar, denegar o suspender los Planes Operativos Anuales de Áreas Protegidas, así como también ampliar o cancelarlos según el cumplimiento de las normas de la Ley Forestal Áreas Protegidas y Vida Silvestre y su Reglamento;

c) Suspender preventivamente la ejecución de los Planes Operativos cuando se compruebe daño ambiental imprevisto;

d) Realizar la supervisión y los procesos de auditoría técnicas y socio ambientales para determinar el cumplimiento de los Planes de Manejo y las actividades desarrolladas en las áreas protegidas y vida silvestre en general;

e) Diseñar y ejecutar actividades de control de incendios, plagas y enfermedades en áreas protegidas y vida silvestre;

f) Proponer al Director/a Ejecutivo/a las políticas, iniciativas de Ley y reglamentarias, así como Manuales e Instructivos que considere necesarios para el buen desempeño de su competencia;

g) Proponer la creación de nuevas áreas protegidas;

h) Administrar el sistema de valoración de bienes y servicios ambientales producidos por las áreas protegidas;

i) Promover la creación de jardines botánicos y zoológicos;

j) Ejecutar las acciones necesarias para la recuperación de las especies declaradas en peligro de extinción por el Instituto Nacional de Conservación y Desarrollo Forestal, Áreas Protegidas y Vida Silvestre o en cumplimiento de Convenios Internacionales;

k) Gestionar la cooperación internacional para el mantenimiento de las áreas protegidas y de la vida silvestre; así como la participación ciudadana en la protección de estas; y

Administrativamente, la Subdirección Ejecutiva de Áreas Protegidas y Vida Silvestre, tiene bajo su jurisdicción los siguientes departamentos y dependencias del ICF:

• Departamento de Áreas Protegidas
• Departamento de Vida Silvestre
• Departamento de Cuencas Hidrográficas y Ambiente
• Departamento de Salud y Sanidad Forestal
• Coordina el Fondo para el Manejo de Áreas Protegidas y Vida Silvestre

Asimismo, la Subdirección Ejecutiva de Áreas Protegidas y Vida Silvestre, coordina la implementación, directa o a través de los departamentos técnicos, de proyectos de cooperación internacional vinculados al manejo y protección de las áreas naturales y vida silvestre, entre los cuales se encuentran:

• Proyecto de Fortalecimiento del SINAPH LifeWeb Iniciative con el financiamiento del KfW.
• Proyecto Conectando Paisajes UICN-KfW.
• Proyecto Conservación del Colibrí Esmeralda en Honduras.
• Proyecto Gestión Forestal para el Manejo de Plagas en Honduras.